La Chlamydia Trachomatis é il principale agente eziologico di patologie a prevalente trasmissione sessuale quali: uretrite non gonococcica (NGU) e post-gonococcica (blenorragia da inclusioni), epididimite, vaginite, sindrome uretrale acuta e, nella donna, malattia pelvica infiammatoria che spesso sfocia nella sterilità di coppia. Altre patologie correlate all’infezione da Chlamydia Tr. sono rappresentate essenzialmente dal linfogranuloma venereo, tracoma, che porta spesso a cecità , dalla congiuntivite da “corpi inclusi” e polmoniti, frequenti nei neonati, contagiati nell’attraversamento del canale cervicale, durante il parto.